公司代扣个人所得税时，会计分录为借：应付职工薪酬贷：应交税费——应交个人所得税。公司代缴个人所得税时，会计分录为借：应交税费——应交个人所得税贷：银行存款。根据个人所得税法规定，居民个人需就其境内外的所得缴纳个人所得税，缴纳金额根据应纳税所得额计算。
公司缴纳个人所得税的会计分录处理如下：
一、代扣个人所得税
当公司从员工工资中代扣个人所得税时：
1. 借： 应付职工薪酬
贷： 应交税费——应交个人所得税
二、代缴个人所得税
公司代缴个人所得税时，具体操作如下：
1. 借： 应交税费——应交个人所得税
贷： 银行存款
补充说明： 根据《中华人民共和国个人所得税法》第六条的规定，对于居民个人，其综合所得在扣除基本费用及其他专项扣除、附加扣除后，剩余部分作为应纳税所得额，需缴纳个人所得税。在中国境内有固定住所或居住一定时间（一个纳税年度内累计满一百八十三天）的个人，均视为居民个人，其境内外的所得均需按照此法纳税。
以上会计分录处理，确保了公司和个人所得税的准确缴纳，遵循了国家的税务法规。在应付职工薪酬与应交税费的借贷关系中，明确了公司的财务责任与个人所承担税务义务的关系。
