医疗机构发生收入时，会计分录处理包括：记录应收账款增加，事业收入——医疗收入增加；收取医疗款款项时，记录银行存款增加，应收账款减少；同时进行预算会计处理，资金结存增加，事业预算收入增加。遵循《关于医院执行<政府会计制度-行政事业单位会计科目和报表>的补充规定》，通过相关科目进行核算。
医疗机构收入会计分录处理
一、医疗机构收入确认时
当医疗机构产生医疗收入时，会计分录如下：
借：应收账款 - 应收医疗款
贷：事业收入 - 医疗收入
二、收取医疗款项时
当医疗机构成功收取医疗款项时，会计分录如下：
借：银行存款
贷：应收账款 - 应收医疗款
三、预算会计处理
同时，进行预算会计处理，会计分录为：
借：资金结存 - 货币资金
贷：事业预算收入
以上会计分录的处理，是根据《关于医院执行<政府会计制度-行政事业单位会计科目和报表>的补充规定》进行的规范操作。在记录医疗机构收入及收取医疗款项的过程中，应使用“应收账款”相关二级科目、“事业收入”相关二级科目以及“资金结存”等科目进行核算。确保每一笔账目清晰明了，以便于后续的财务管理与审计。
