根据原文，如果工资由总公司发放并由总部代扣代缴个人所得税，分公司则不需要再次申报个税。国家税务总局的规定明确了扣缴义务人是决定支付对象和支付数额的单位或个人，因此只要总公司已经履行了扣缴义务，分公司无需再次申报个税。
关于总部代扣代缴个人所得税后分公司税务处理说明
根据国家税务总局的相关规定，当总部已代扣代缴个人所得税后，分公司通常不需要再次申报个税。这一处理的依据在于工资是由总公司发放，相应的个人所得税也在总公司进行了申报和扣缴。
一、关于扣缴义务人的定义
根据《国家税务总局关于个人所得税偷税案件查处中有关问题的补充通知》（国税函[1996]602号）的规定，对所得的支付对象和支付数额有决定权的单位和个人，被认定为扣缴义务人。这意味着，如果总公司负责工资的发放，它也就承担了个人所得税的扣缴义务。
二、总部的代扣代缴职责
总部在发放工资时，已经按照国家的税务政策代扣了员工的个人所得税，并完成了相应的税款缴纳工作。
三、分公司的税务处理
在此情况下，分公司通常不需要进行个人所得税的申报。但分公司仍需履行其他税务相关的职责，确保公司的税务合规。
在总部已代扣代缴个人所得税的前提下，分公司无需再次申报个税，但仍需关注并履行其他税务职责，确保公司税务的正常运作。
