公司代扣个人所得税的分录是，通过借记“应付职工薪酬—工资”，贷记“应交税费—个人所得税”的方式进行核算。公司代扣个人所得税会导致应付职工薪酬减少，同时应交税费增加，分别进行借方和贷方核算。
公司代扣个人所得税的会计分录如下：
当公司代扣员工的个人所得税时，首先涉及的是应付职工薪酬的减少。这一操作记录于借方，具体分录为：借：应付职工薪酬—工资。
随着个人所得税的代扣，公司的代扣责任使得应交税费增加。这部分增加的税费被记录于贷方，具体分录为：贷：应交税费—个人所得税。
对于这一分录的详细解释，我们可以理解为：
1. 公司代扣个人所得税后，员工应得的工资会减少相应的税款金额，因此应付职工薪酬—工资会减少，体现在借方。
2. 同时，公司需要为代扣的个人所得税向税务部门缴纳，因此应交税费—个人所得税会增加，显示在贷方。
通过这样的分录，公司能够清晰地反映出代扣个人所得税的财务变动情况。
