根据财税[2013]106号文件，对于国际货物运输代理，货代公司提供的代理服务费和海运费都可以抵扣增值税进项税额。但如果货代公司与出口运输单位直接签订运输合同，则不能开具增值税专用发票进行抵扣。因此，小货代公司为前述货代公司提供代理服务时，可以开具增值税专用发票并抵扣增值税进项税额。
海运费与增值税进项税额抵扣详解
根据财税[2013]106号文件的规定，针对国际货物运输代理业务的增值税处理，具体规定如下：
一、关于货代公司开具发票的情况：
当纳税人（即货代公司）为委托方提供国际货物运输代理服务，并应委托方要求开具发票时，货代公司需向委托方全额开具增值税普通发票。这一过程中涉及的具体规定如下：
直接签订运输合同的货代公司情况：
对于直接与出口运输单位签订运输合同的货代公司，它们不能开具增值税专用发票，因此无法为海运费和代理服务费进行增值税进项税额的抵扣。
为前述货代公司提供代理服务的小货代情况：
这些小货代为那些直接与出口运输单位签订合同的货代公司提供代理服务，并可以开具增值税专用发票。它们所提供的代理服务费和海运费都可以抵扣增值税进项税额。
二、关于增值税进项税额的抵扣：
如上所述，代理服务费和海运费在符合条件的情况下都可以抵扣增值税进项税额。这一政策为相关企业和行业提供了明确的税务处理指南。
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