当企业收到的工程款小于开具的发票金额时，若后续仍有望收到剩余款项，可将其挂在应收账款科目，待收到款项后再进行冲减。若后续无法再收到款项，则可作为坏账处理或开具红字发票进行冲减。
企业面对收到的工程款小于开具发票金额的情况，可采取以下处理方式：
1. 若后续还将收到对方工程款：
将差额部分挂在应收账款科目。具体分录为：
借：应收账款
贷：相关收入科目（根据实际业务情况确定）
待后续收到款项时，进行冲减。分录为：
借：银行存款
贷：应收账款
2. 若后续不会再收到剩余款项：
这部分差额可以作为坏账处理，或者通过开具红字发票进行冲减。选择坏账处理时，需进行坏账准备计提，具体分录为：
借：坏账准备
贷：应收账款
若选择开具红字发票冲减，则根据红字发票进行相应账务调整。
在处理这类账务问题时，企业需根据实际情况选择合适的处理方式，并确保相关账务处理符合财务准则与法规。同时，企业还应加强应收账款的管理，降低坏账风险，确保资金安全。
