当企业实际收到的增值税发票数量或开具的发票数量大于合同数量时，需根据不同情况处理。若实际履行金额大于合同金额，可按实际履行金额开票；若是开票错误导致数量多开，需重新开具对应发票。处理时需确保符合合同条款和法规要求。
企业面对增值税发票数量大于合同数量的情况时，需根据实际情况进行妥善处理。针对这种情况，一般可按以下两种情形处理：
一、实际履行金额大于合同金额的情况
当企业实际收到的货物或提供的服务导致实际履行金额大于合同金额时，开具增值税发票的数量自然也会相应增加。在这种情况下，企业完全可以根据实际交易金额开具发票，确保发票的真实性。
二、发票开具错误的情况
但在另一种情况下，企业在开具发票时出现了失误，即发票上的数量超过了合同规定的数量。这种误差可能是由于操作失误或其他原因造成的。对此，企业应尽快进行纠正，重新开具与合同数量相符的发票。
具体操作时，企业需仔细核对合同细节和发票内容，确保准确无误。对于因开具错误而导致的多余发票，应当进行作废处理，并重新按照合同规定的内容和数量开具正确的发票。同时，企业还需加强内部管理，防止类似情况再次发生。在此过程中，相关的账务调整应同步进行，确保财务记录的准确性。
