预缴增值税时缴纳的附加税一般不能计算抵扣。因为预缴增值税的同时已经缴纳了附加税，实际缴纳增值税时抵减了预缴的增值税，附加税则按照再次缴纳的增值税计算。因此，预缴的附加税不能用于抵减后续的附加税。
预缴增值税下的附加税处理
对于一般纳税人而言，附加税的计算基础是企业实际缴纳的增值税金额。在常规的税务操作中，预缴的增值税所关联的附加税并不能直接计算抵扣。
当企业预缴增值税时，同时也就缴纳了相应的附加税。当增值税实际缴纳时，会抵减预缴的增值税，这样自然减少了再次缴纳的增值税金额。而附加税的计算，则依据是增值税实际缴纳后的金额。
具体来说，附加税的计算流程如下：
一、预缴增值税时的税务处理
当企业预缴增值税时：
1. 增值税预缴：企业按照预计的销售额预缴增值税。
2. 附加税预缴：与此同时，企业需要按照预缴的增值税金额计算并预缴相应的附加税。
二、实际缴纳增值税时的税务处理
在实际缴纳增值税时：
1. 增值税抵减：企业可以用预缴的增值税来抵减实际应缴纳的增值税。
2. 附加税计算：附加税的计算基础是抵减后的实际增值税金额。也就是说，如果预缴的增值税已经足够抵减实际应缴的增值税，那么企业就不需要再次缴纳附加税。
在正常的税务操作流程中，预缴的附加税并不能直接计算抵扣，而是根据实际缴纳的增值税金额来计算附加税。
