劳务派遣差额征税开票有两种方式。方式一：开具增值税专用发票时，扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利等费用，仅对余额部分征税；方式二：全额开具增值税普通发票并依5%的征收率征税。具体选择哪种方式，需根据实际情况和需求决定。
劳务派遣差额征税开票详解
劳务派遣差额征税开票，可以通过以下两种方式实现：
一、详细开票方式
1. 通过增值税发票管理新系统中的正常开票功能，以取得的全部价款和价外费用为基础进行开票。
2. 在开票时，需扣除代用工单位支付给劳务派遣员工的工资、福利以及为其办理的社会保险及住房公积金。
3. 余额部分按照5%的征收率开具增值税专用发票。
4. 代用工单位支付的费用，同样按照5%的征收率开具增值税普通发票。
二、另一种开票方式
1. 同样通过增值税发票管理新系统的正常开票功能。
2. 以取得的全部价款和价外费用全额为基础，按照5%的征收率开具增值税普通发票。
具体操作流程：
1. 登录增值税发票管理新系统。
2. 选择正常开票功能。
3. 录入相关金额和费用信息。
4. 根据选择的方式，扣除或全额开票。
5. 选择相应的税率（5%），开具增值税专用发票或增值税普通发票。
请注意，以上两种方式均需要严格按照国家税务政策执行，确保开票信息的准确性和合法性。企业在选择开票方式时，应根据自身实际情况和税务政策要求，选择最合适的方式。
