增值税发票抵扣联丢失了不影响认证。如果纳税人同时丢失发票联和抵扣联，可凭销售方发票专用章的记账联复印件作为抵扣凭证或退税凭证。如果只丢失抵扣联或发票联，也可凭相应的发票联或抵扣联复印件作为凭证。因此，增值税发票抵扣联丢失不会导致无法认证或处理。
增值税发票抵扣联丢失对认证的影响及应对措施
当增值税发票抵扣联丢失时，纳税人无需过于担心，因为这种丢失并不影响发票的认证。具体地说：
一、抵扣联丢失不影响认证
如果纳税人同时丢失了已开具的增值税专用发票或机动车销售统一发票的发票联和抵扣联，可以采取以下措施：
1. 可凭加盖销售方发票专用章的相应发票记账联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证、退税凭证或记账凭证。
二、具体应对措施
1. 抵扣联丢失：纳税人可凭相应发票的发票联复印件，作为增值税进项税额的抵扣凭证或退税凭证。
2. 发票联丢失：如果发票联丢失，纳税人可以凭借相应发票的抵扣联复印件，作为记账凭证。
在实际操作中，纳税人应保持发票的妥善保管，避免丢失带来的不便。一旦遇到丢失情况，及时采取措施，确保不影响正常的税务处理。同时，税务部门也提供了相应的服务支持，帮助纳税人解决这类问题。通过这样的措施，确保了税收工作的顺利进行，也保障了纳税人的合法权益。
