总公司代发分公司员工工资时，分公司的个税申报流程与自行发放工资一致。分公司需在员工实际取得工资的申报期限内进行申报，并将相关款项在账上作为往来款项记录。在此过程中，分公司的申报责任并未因工资代发而改变。
总公司代发分公司员工工资个税申报流程
当总公司代替分公司发放员工工资时，关于个人所得税的申报，分公司需自行操作。具体流程如下：
1. 分公司自行申报所属员工的个税
在实际发放工资后，分公司需按照规定的申报期限，对其所属员工的个人所得税进行申报。申报内容应包括员工的工资收入及其他相关税务信息。
2. 总公司代发工资的处理
总公司代替分公司发放工资，在账务上，分公司账上应作为往来款项进行记录，以确保账务的准确性和规范性。
3. 申报操作与工资发放操作一致
分公司进行个税申报的操作，与自行发放工资时的操作是一致的，无需因总公司的代发行为而做出特殊调整。
注意事项：
1. 确保申报内容的准确性。
2. 遵循规定的申报期限，及时完成申报工作。
3. 在账务处理上，分公司需明确记录与总公司之间的工资往来。
以上内容基于公司实际业务流程进行描述，请各公司根据实际情况进行操作和调整。
