减免税审计需注意的关键点包括：首先，实施审计时应延伸考察，不仅审查税务部门资料，还需审核企业财务信息，并对重点企业进行深入审计。其次，明确区分税务机关与企业在减免税违规问题上的责任，确保公正评估双方过错。再次，特别关注对外商企业的税收减免，确保其符合国内税法及国际惯例，防止避税行为损害国家及本土企业利益。最后，审计工作应对税务部门绩效给予客观评价，既要指出审计发现的问题及其成因，提出改进建议，也要肯定其利用税收优惠扶持企业发展、推动经济增长的积极作用。
在开展减免税审计工作的过程中，需细致考虑以下几个关键点：
1. 延伸审计的重要性
实施减免税审计时，应充分利用税务部门提供的信息资源，仔细核查减免税档案及企业财务结算资料。必要情况下，针对重点企业采取延伸审计措施，以深入把握实际情况，确保审计的全面性和准确性。
2. 明确责任归属
遇到审计中揭露的违纪行为，至关重要的是要清晰界定税务机关与企业各自的职责界限。税务机关可能存在的违纪行为主要包括越权减免税或在权限内违背国家规定进行减免，而正确区分责任有助于公正处理问题。
3. 关注外资企业减免税合规性
为顺应国际通行做法，优化投资环境，有效防范国际避税行为，保障我国经济利益和企业合法权益，审计时需特别留意外资企业享受的减免税政策是否严格遵循我国税法相关规定，确保税收优惠政策合理合法实施。
4. 全面评估税务部门工作成效
审计不仅旨在发现问题，更要通过问题分析其成因，并提出建设性改进建议。同时，应对税务部门运用减免税政策工具，在支持企业发展、拓宽财政来源、推动经济增长方面所起的积极作用给予客观公正的评价，体现审计的指导与促进功能。
通过上述措施的实施，减免税审计能够更加有效地服务于税收管理的规范化、透明化，促进税收政策的合理执行与经济的健康发展。
