经济效益审计程序包括四个阶段：准备阶段主要收集信息、拟定提纲、选择标准、制定计划和发出通知；实施阶段主要听取介绍、询问问题、审计方法找出原因、测算数据和提出建议；终结阶段作出客观公正、有建议性的总结报告；后续阶段督促企业落实审计建议、检验结论、总结经验并提升审计水平。该程序贯穿效益审计工作的全过程。
经济效益审计程序的主要阶段
在经济效益审计过程中，主要涉及到以下四个关键阶段：
一、准备阶段
此阶段主要任务是收集与被审计单位相关的资料信息，并针对审计目标拟定详细的审计调查提纲。同时，选择适当的审计标准，制定周密计划，并发出审计通知。这一阶段是审计工作的基石，为后续的审计工作奠定坚实基础。
二、实施阶段
实施阶段核心工作包括听取被审计单位的详细介绍，对重要问题详细询问并澄清。审计人员会运用各种审计方法，深入探究经济效益的优劣原因，精确测算相关数据，并提出针对性的建议。同时，确保审计数据的准确性和完整性。
三、终结阶段
在这一阶段，审计人员会对审计情况进行客观公正的评估，并编写含有建议性的总结报告。此报告是对整个审计工作的汇总和评价，旨在为被审计单位提供明确的方向和建议。
四、后续阶段
此阶段的重点在于督促企业落实审计建议，检验审计结论的实际效果，总结经验并提升经济效益审计的水平。这一步骤确保了审计工作的实际效果和持续性改进。
以上四个阶段构成了经济效益审计的完整程序，确保了效益审计工作从起始到结束的有序进行。
