一、对于一般纳税人：
1.当企业提供应税服务时，若允许从销售额中扣除其支付给非试点纳税人的价款，应在“应交税费-应交增值税”科目下增设“营改增抵减的销项税额”专栏。当扣减销售额而减少的销项税额时，借记“应交税费-应交增值税（营改增抵减的销项税额）”科目。同时，“主营业务收入”和“主营业务成本”等相关科目应按照业务种类进行明细核算。
2.当企业接受应税服务时，按允许扣减的销售额而减少的销项税额，同样借记“应交税费-应交增值税（营改增抵减的销项税额）”科目。此时，按实际支付或应付的金额与上述增值税额的差额，借记“主营业务成本”等科目，并按实际支付或应付的金额贷记“银行存款”“应付账款”等科目。
3.对于期末一次性进行账务处理的企业，在期末时，按当期允许扣减的销售额而减少的销项税额进行会计处理，具体科目借贷记录同上。
二、对于小规模纳税人：
1.当提供应税服务时，允许从销售额中扣除其支付给非试点纳税人的价款，此时减少的应交增值税应直接冲减“应交税费-应交增值税”科目。
2.接受应税服务时的会计处理与一般纳税人相同，即借记相关增值税科目，然后按实际支付或应付的金额与增值税额的差额借记“主营业务成本”等科目，并贷记相应科目。
3.期末一次性处理的账务时，也按照上述方式进行会计处理。
差额交增值税的会计分录处理需要根据纳税人的身份（一般纳税人与小规模纳税人）以及业务的具体情况（提供应税服务或接受应税服务）进行具体的会计处理。
