增值税发票认证方式包括：携带增值税与用发票抵扣联等资料到税务机关申报征收窗口或自助办税机认证；自行扫描、识别与用发票抵扣联票面信息，通过网络传输至税务机关进行解密和认证；使用增值税发票选择确认平台查询并勾选确认用于申报抵扣、出口退税或代办退税的增值税发票信息。登录地址由各省、自治区、直辖市和计划单列市税务局确定并公布。
一、现场认证
一般纳税人取得增值税发票（包括增值税专用发票、机动车销售统一发票、收费公路通行费增值税电子普通发票）后，可以携带增值税发票的抵扣联等资料，前往税务机关的申报征收窗口或者自助办税机（ARM机）进行认证。
二、网上认证
纳税人也可选择自行扫描、识别增值税专用发票抵扣联的票面信息，生成电子数据，然后通过网络传输至税务机关。税务机关会完成解密和认证，并将认证结果信息返回给纳税人。
三、增值税发票选择确认平台
对于纳税人取得的销售方使用增值税发票系统升级版开具的增值税发票，可以通过特定的网址，进入增值税发票选择确认平台进行查询。通过勾选和确认的形式，纳税人可以完成发票认证。纳税人可自愿使用此平台查询、选择用于申报抵扣、出口退税或代办退税的增值税发票信息。增值税发票选择确认平台的登录地址由国家税务总局各省、自治区、直辖市和计划单列市税务局确定并公布。
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