代扣代缴手续费收入的会计处理有三种观点，但根据相关规定和通知，企业应将其记入“其他业务收入”，并单独核算，用于代扣代缴管理支出和适当奖励相关工作人员。手续费收入涉及营业税和所得税，应按照规定交纳。该收入是企业提供劳务后取得的，符合劳务收入的确认原则。
对于企业取得的代扣代缴个人所得税手续费收入，存在三种主要观点：记入往来款项、记入“其他业务收入”和记入“营业外收入”。那么，正确的处理方法是什么呢？
首先，根据《个人所得税代扣代缴暂行办法》的规定，手续费收入应用于代扣代缴费用开支和奖励代扣代缴工作表现优秀的办税人员，而并非全部用于奖励。《关于进一步加强代扣代收代征税款手续费管理的通知》明确指出，单位取得的手续费收入应单独核算，计入本单位收入，用于“三代”管理支出，也可以适当奖励相关工作人员。该收入不应计入往来款项，而应计入单位收入。
从会计处理的角度来看，代扣代缴手续费是企业提供一定劳务后取得的收入。当企业正常履行代扣代缴义务时，该经济利益便可确定获得。由于手续费收入的比例是确定的，因此该经济利益也是可以计量的。这符合劳务收入的确认原则。基于此，企业应将该手续费收入记入“其他业务收入”，而非“营业外收入”。相应的，有关代扣代缴费用开支和对代办人员的奖励支出也应记入“其他业务支出”。
在税收方面，手续费收入主要涉及流转税和企业所得税。在流转税方面，由于该收入是企业提供劳务而得的，因此应按照营业税中的“其他服务业”税目，以5%的税率交纳营业税。在所得税方面，该手续费不仅在会计上应作为收入核算，在税法上，也应并入企业应纳税所得额，缴纳企业所得税。
特别对于储蓄机构取得的手续费收入，《关于代扣代缴储蓄存款利息所得个人所得税手续费收入征免税问题的通知》规定，应按照规定交纳营业税和所得税。
企业应正确处理和记录代扣代缴手续费收入，确保符合相关法规和会计准则，以避免不必要的税务和会计风险。
