在进行发票协查后，有时可能需要补交增值税。对于会计分录的处理，具体分为以下几种情况：
一、如果是本年度正常的补缴增值税
1.分录处理
当需要补交本年度的增值税时，会计分录如下：
借：应交税金--应交增值税*
贷：银行存款等*
表示公司需要补交本年度的增值税，并从银行账户中划款。
二、如果是以前年度查账补交
1.计提及调整*
对于以前年度的查补增值税，首先需要进行计提和调整。
借：以前年度损益调整*
贷：应交税费--增值税检查调整*
表示经过查账后，对以前年度的税务进行调整。
2.查补转出*
将查补的增值税转出。
借：应交税费--增值税检查调整*
贷：应交税费--未交增值税*
表示查补的增值税需要从当前的未交增值税中划出。
3.补交增值税*
实际补交增值税时。
借：应交税费--未交增值税*
贷：银行存款*
表示从银行账户中划款，补交之前的未交增值税。
4.结转损益调整*
最后，对损益进行调整。
借：利润分配--未分配利润*
贷：以前年度损益调整*
表示对之前年度的损益进行调整，并反映在当前的利润分配中。
以上是针对发票协查补交增值税的会计分录处理。不同的情境下，具体的分录处理有所不同，需要根据实际情况进行准确记录。希望以上解答能够帮助您更好地理解和处理相关税务问题。
