当控股子公司因各种原因注销后，母公司在财务上需要采取一系列措施来处理与已注销子公司相关的财务事宜。以下是具体的处理方法和步骤：
一、参照财政部相关规定进行销账处理
根据财政部《企业兼并有关会计处理问题暂行规定》的相关内容，对于丧失法人资格并结束运营的企业，例如注销的控股子公司，在进行旧账结束时，需按照以下步骤操作：
1.借记所有负债和所有者权益科目的余额。
2.贷记所有资产科目的余额。
当子公司完成清算并办理注销登记后，执行上述操作，确保公司所有科目余额为零，以此完成销账工作。
二、会计档案的处理
《财政部、国家档案局关于印发〈会计档案管理办法〉的通知》中明确指出，单位若因撤销、解散、破产或其他原因而终止，在终止和办理注销登记手续之前，需对其形成的会计档案进行妥善处理。母公司在处理与已注销子公司的财务关系时，也应关注会计档案的移交、保管或销毁等工作，确保符合档案管理规定。
三、注意事项
1.在处理与已注销子公司的财务关系时，母公司需严格按照国家财务、税务相关法律法规进行操作。
2.对于涉及子公司的未决事项和潜在负债，母公司需进行充分评估和清理，确保无遗漏。
3.母公司应妥善保管与子公司相关的财务资料，以备后续可能的审计或查询。
以上就是针对控股子公司注销后母公司财务处理的相关解答。在实际操作中，母公司还需根据自身的实际情况，结合相关法规，制定具体的财务处理方案，确保财务处理的准确性和合规性。
