支付土地补偿款的会计处理为：首付款挂预付账款，待产权手续办理后依据企业性质转入不同科目。若土地用于建厂房自用，则转入在建工程，最终转为固定资产，属于企业投资性质。若为房地产企业购买土地，则转入存货-土地储备。购买土地时借无形资产-土地使用权，贷银行存款。缴纳相关税费时，借管理费用，贷应交税费。
一、首付款的暂时处理
对于支付土地补偿款的首付款，由于相关产权手续可能尚未办理完毕，通常只能暂时挂在预付账款科目。这样做是为了确保会计记录的准确性和合规性，待产权手续办理后再进行进一步的会计处理。
二、依据企业性质进行会计处理
1.准备在土地上建厂房自用：
如果企业计划购买土地后自建厂房并使用，那么会计处理上会将相关款项从预付账款转到在建工程。待工程完工后，再转入固定资产。这种处理方式反映了企业对于土地及厂房的长期投资。
2.属于企业投资性质：
对于一般企业而言，购买土地是一种长期投资。在产权手续办理完毕后，相关款项会从预付账款转到无形资产——土地使用权。这反映了企业为扩大经营或进行长期投资而支付的土地补偿款。
3.房地产企业为房产开发：
对于房地产企业来说，购买土地是为了储备土地进行房地产开发。相关款项会从预付账款转到存货——土地储备。
三、相关税费的会计处理
在缴纳与土地相关的税费（如土地税、契税）时，会计上需要进行相应的记录。具体的会计处理为：借管理费用，贷应交税费——应交契税、土地税。这反映了企业在运营过程中发生的税费支出。
支付土地补偿款的会计处理需要根据企业的性质和用途进行具体的分录处理，确保会计记录的准确性和合规性。希望以上解答能够帮助您更好地理解支付土地补偿款的会计处理。
