电子商票系统年费做账可通过借：财务费用；贷：库存现金或银行存款的方式记录。电子商业承兑汇票相较于传统纸质商票具有无法比拟的优势，如打破流通与结算壁垒、成为流动性贷款的有效替代品、降低票据风险和结算成本以及业务办理渠道的多样化。这些优势提升了效率，降低了成本，对企业和商业银行都有重要意义。
针对电子商票系统的年费，企业在做账时，一般将其记入“财务费用”科目。当企业支付电子商票系统的年费时，会计分录可如下：
借：财务费用
贷：库存现金/银行存款
这样，企业可以清晰地将年费成本反映在财务报表中，有助于管理者了解和分析企业的运营成本和效益。
电子商票的优势与传统纸质商票的比较
电子商票与传统的纸质商业汇票相比，具有许多无法比拟的优势。首先，电子商票打破了流通与结算的行际壁垒，不受行别和区域的限制。传统的纸质商票存在诸多因素，如各行别的纸质票据的印制、签章样式以及处理纸质商票的业务系统的差异，这些因素明显影响了纸质商票的背书、贴现及结算效率。而电子商票以数据电文取代纸质凭证，以电子签名取代实体签章，每一份电子商票均以一串30位字符为标识存储在电子商票系统中，从而大大提高了效率。
其次，电子商票成为了流动性贷款的有效替代品。其付款期限最长可达1年，限额扩大至10亿元，且每周7×24小时都可办理，这些特点为企业票据融资提供了更大的操作空间，间接降低了融资成本。
电子商票还降低了与实物相关的票据风险和结算成本。对于企业和银行来说，纸质商票的保管、传递、真伪鉴定都需要大量的人力、物力成本，并且存在风险。而电子商票存储在系统中，不仅具备纸质商票的所有功能，还能有效防范伪造、变造、克隆等带来的票据纠纷和资金风险。
最后，电子商票的办理渠道更加广泛，可以通过多种渠道进行业务办理，如商业银行的柜面、企业网银等电子渠道，实现了银企业务的无缝对接。
电子商票系统的年费做账应记入“财务费用”科目。电子商票相较于传统纸质商票具有诸多优势，如提高效率、降低风险、拓宽融资空间等。
