发放工资少发放的部分计入其他应付款科目。少发时，钱还在公司账户，形成其他应付款差额；正常发放时，应付职工薪酬总额；补发时，通过其他应付款差额和银行存款差额进行核算。其他应付款科目包括应付租入固定资产和包装物租金、职工未按期领取的工资、存入保证金等。企业应设置明细账进行明细分类核算。
当企业发放工资时，如果工资发放的金额少于应发的金额，这部分差额应作为企业的负债进行处理。具体的会计处理如下：
1.在少发工资时，由于钱还在公司账户，会计分录为借：银行存款差额，贷：其他应付款差额。这是因为应付职工薪酬的总额并未完全支付，差额部分暂时成为公司的债务，属于其他应付款的范畴。
2.正常发放工资时，会计分录为借：应付职工薪酬总额，贷：银行存款总额。此时，应付职工薪酬的总额已经支付完毕。
3.如果后续进行补发工资，会计分录为借：其他应付款差额，贷：银行存款差额。此时，之前未发放的工资已经补发，其他应付款的差额已经支付完毕。
“其他应付款”科目主要核算企业发生的应付、暂收其他单位或个人的款项，包括应付经营租入固定资产和包装物租金、职工未按期领取的工资等。对于发放工资少发放的部分，就是属于职工未按期领取的工资，应该通过其他应付款科目进行核算。
以上详细解答了“发放工资少发放的部分计入什么科目”这一问题，希望对您有所帮助。
