税控系统抵减会计分录的处理方法为：购买增值税税控系统专用设备时，将费用记入固定资产或管理费用等，同时贷记银行存款。然后，将相应的增值税金额记入应交税费--应交增值税，并贷记营业外收入。支付税控系统技术维护费时，同样记录管理费用和银行存款，再将增值税部分记入应交税费--应交增值税，并贷记营业外收入。这样处理可确保税控系统费用在增值税应纳税额中全额抵减。
自2011年12月1日起，增值税纳税人购买初次增值税税控系统专用设备所支付的费用及缴纳的技术维护费，可以在增值税应纳税额中全额抵减。对于会计人员而言，正确处理税控系统抵减的会计分录是十分重要的。
一、购买增值税税控系统专用设备的处理
当企业购买增值税税控系统专用设备时，会计分录处理如下：
1.借方账户处理：根据设备价值，记入“固定资产”科目（或管理费用等）相应金额。例如，购买税控系统专用设备5000元（含税价），借记“固定资产”或“管理费用”5000元。
2.贷方账户处理：同时，通过银行存款账户支付相应款项，贷记“银行存款”5000元。
3.抵减增值税处理：由于可抵减增值税，需借“应交税费--应交增值税”5000元，并贷“营业外收入”5000元。这样，增值税的抵减通过营业外收入体现。
二、支付税控系统技术维护费的会计处理
对于支付的技术维护费，会计分录如下：
1.借方账户处理：将维护费用记入“管理费用”科目，例如支付技术维护费2000元，借记“管理费用”2000元。
2.贷方账户处理：通过银行存款账户支付该笔费用，贷记“银行存款”2000元。
3.抵减增值税处理：同样，借“应交税费--应交增值税”2000元，贷“营业外收入”2000元。
通过以上会计处理，企业能够准确记录税控系统的购买及维费用护，并在增值税中合理抵减。这不仅符合会计原则，也确保了企业的税务合规。
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