企业申请抵扣的时间条件为：一般纳税人申请抵扣的防伪税控系统开具的增值税专用发票及其他需认证抵扣的发票，需在开具之日起180日内认证，否则不予抵扣。对于进口货物，取得海关完税凭证后应在开具之日起90日后的第一个纳税申报期结束前申报抵扣。对于2010年1月1日以后开具的海关收款书，需在开具之日起180日内向主管税务机关报送清单申请稽核比对。纳税人取得2009年12月31日前的增值税扣税凭证，仍按原规定执行。
在企业税务处理过程中，抵扣进项税额是一个重要的环节。针对企业申请抵扣的时间条件，有以下具体规定：
一、防伪税控系统开具的增值税专用发票及其他需认证抵扣的发票
一般纳税人取得的防伪税控系统开具的增值税专用发票以及其他需要进行认证抵扣的发票，必须从该专用发票开具之日起180日内进行认证。只有在这个时间范围内完成的认证，企业才能抵扣相应的进项税额。超出这个时间限制，将不予抵扣进项税额。
二、进口货物的抵扣规定
对于进口货物，一般纳税人在取得海关完税凭证后，应在开具之日起90日后的第一个纳税申报期结束以前向主管税务机关申报抵扣。这意味着，企业必须在这个特定的时间框架内向税务机关申请抵扣，逾期则不得抵扣进项税额。
三、特定时间段的海关收款书抵扣
对于2010年1月1日以后开具的海关收款书，企业应在开具之日起180日内向主管税务机关报送《海关完税凭证抵扣清单》申请稽核比对。这一规定实行“先比对后抵扣”的原则，确保流程规范，避免逾期造成的不便。
四、旧增值税扣税凭证的处理
对于纳税人取得的2009年12月31日以前开具的增值税扣税凭证，仍按照原规定执行。这意味着对于这些旧凭证的抵扣操作，企业应遵循当时的政策和规定。
企业在申请抵扣进项税额时，必须严格遵守相关规定的时间条件，确保在指定时间内完成认证和申报工作，避免因逾期而造成的不必要的税务困扰。
