预缴税时没扣除分包款会导致企业多交部分税款。但预缴的增值税可以抵扣进项，且预缴税率通常为2%。对于建筑行业，要根据提供的建筑服务的纳税义务发生时间进行区分，适用不同的税率进行计算。不扣除分包款时，应预缴税款计算公式要相应调整。此外，提供建筑服务取得预收款时，可以开具不征税的增值税普通发票，但不属于纳税义务发生时间。不扣除分包款的影响需根据具体情况判断，建议咨询专业人士获取准确解答。
当预缴税时没有扣除分包款，意味着企业预缴的税款金额会偏高，相当于多交了部分税款。这是因为预缴的增值税是可以抵扣进项的，如果没有扣除分包款，会导致计算出的预缴税款金额不准确。特别是在建筑行业，预缴税款的计算涉及到多个方面，如提供的建筑服务、租赁服务的预收款方式等。
对于建筑行业预缴增值税的影响，具体可分为以下几点：
1.纳税义务发生时间：根据《营业税改征增值税试点实施办法》第四十五条第二款的规定，纳税人提供建筑服务、租赁服务采取预收款方式的，纳税义务发生时间为收到预收款的当天。预缴税款的计算与收款时间密切相关。
2.税率调整：自2018年5月1日起，提供建筑服务缴纳的税率调整为10%。企业在预缴税款时需要根据最新的税率进行调整。
3.账务处理：在建筑行业的预缴增值税账务处理中，一般计税方式下，需要通过相应的会计科目进行记录，如银行存款、预收账款、应交税费等。
如果没有扣除分包款，会导致预缴税款计算不准确，可能给企业带来不必要的负担。为了解决这个问题，企业需要根据取得预收款所对应的建筑服务的纳税义务发生时间进行区分，并适用相应的税率进行计算。对于一般计税方式，应预缴税款的计算公式为：(全部价款和价外费用-支付的分包款)÷(1+税率)×预缴税率。
企业在提供建筑服务取得预收款时，可以按规定开具不征税的增值税普通发票。但对于开具发票的当天，也属于纳税义务发生时间。企业在开具发票时也需要考虑到相应的税务处理。
预缴税时扣除分包款是确保企业税务处理准确的重要步骤。企业应根据相关规定进行计算和账务处理，以避免因计算不准确而带来的不必要的税务负担。
