施工合同预缴的增值税不算开票金额。建筑企业预交的增值税是按合同金额的不含税金额来计算，也就是开发票金额（结算金额）。开具增值税专用发票时，需遵循相关规定，如项目填写齐全、字迹清楚、加盖单位发票专用章等。
在建筑行业中，施工合同预缴增值税并不直接算作开票金额。
一、预缴增值税与开票金额的概念
1.施工企业预交的增值税是按照合同金额的不含税金额来计算的。也就是说，预缴的增值税并不是最终的开票金额。
2.开发票金额（结算金额）是施工合同中的实际交易金额，也是最终开具增值税专用发票的金额。
二、增值税专用发票的开具规定
1.项目填写要求：项目内容需完整，所有联次必须一次填开，上下联内容一致。
2.字迹清晰：不得涂改，如有误填需另行开具并在误填的发票上注明“误填作废”。
3.盖章要求：发票联和抵扣联需加盖单位发票专用章，不得使用其他财务印章。销货单位栏需预先加盖专用戳记，不得手工填写。
4.金额与税额填写：金额、税额栏合计数前需用特定符号封顶。
5.购销双方单位名称：必须详细填写，不得简写。如果单位名称过长，可在名称栏分上下两行填写。
三、关于退货与折让的处理
发生退货或销售折让时，需按规定处理收到的购货方抵扣联和发票。
四、税务机关代开专用发票的特别要求
税务机关代开专用发票时，除加盖纳税人财务专用章外，还必须加盖税务机关代开增值税专用发票章。专用章需加盖在专用发票底端的中间位置。
施工合同预缴的增值税并不是开票金额。开票金额是最终结算的实际金额，而预缴增值税是基于合同不含税金额的预先缴纳。在开具增值税专用发票时，需严格遵守相关规定，确保发票的合法性和有效性。
