购进的农产品增值税抵扣税率根据具体情况而定。若取得一般纳税人开具的增值税发票或海关进口增值税专用缴款书，以票面增值税额为进项税额；若取得小规模纳税人开具的增值税专用发票，以不含税金额乘以10%为进项税额；若取得自开或代开农产品收购发票、自产农产品销售发票，以发票上注明金额乘以10%为进项税额。此外，纳税人购进用于生产销售或委托加工16%税率货物的农产品，以取得发票上注明的金额乘以12%为进项税额。具体要求还需根据税收法规和会计实务操作进行。
当企业购进农产品时，需要进行计算抵扣进项税额。具体的增值税抵扣税率如下：
一、一般纳税人开具的增值税发票或海关进口增值税专用缴款书，以票面增值税额为进项税额。这种情况下，抵扣税率取决于开具的增值税发票上的具体税额。
二、对于小规模纳税人，如果取得增值税专用发票，以增值税专用发票上注明的不含税金额乘以10%为进项税额。也就是说，小规模纳税人购进农产品时，可以按照购买金额的10%进行抵扣。
三、对于自开或代开的农产品收购发票，以农产品收购发票上注明的金额乘以10%为进项税额。这意味着，企业如果自行开具或委托他人代开农产品收购发票，也可以按照收购金额的10%进行抵扣。
四、如果取得自产农产品销售发票，以农产品发票上注明的金额乘以10%为进项税额。也就是说，销售自产农产品的企业可以按照销售金额的10%进行抵扣。
五、对于纳税人购进用于生产销售或委托加工16%税率货物的农产品，以取得发票上注明的金额乘以12%为进项税额。这意味着，特定用途的农产品购进可以按照购买金额的12%进行抵扣。
企业在购进农产品时，可以根据不同情况选择不同的抵扣税率。但需要明确的是，增值税实行凭增值税专用发票抵扣税款的制度，要求企业能够准确核算销项税额、进项税额和应纳税额。由于实际情况中有很多纳税人的会计核算水平达不到这一要求，因此纳税人被划分为一般纳税人和小规模纳税人。
