补充医疗保险费的处理在会计上需要遵循一定的步骤。根据存货会计准则的规定，补充医疗保险费应计入存货成本。但对于非正常消耗的直接生产人员和直接提供劳务人员的补充养老保险费、补充医疗保险费，在发生时确认为当期损益。
一、计提补充医疗保险费
1.根据职工服务的受益对象，将补充医疗保险费计入相关的成本费用账户。
2.确认负债，会计分录为：借生产成本、制造费用、管理费用、销售费用等，贷应付职工薪酬——补充医疗保险。
二、企业自行建造的固定资产的补充医疗保险处理
对于企业自行建造的固定资产，在建造该项固定资产达到预定可使用状态前所发生的补充养老保险费、补充医疗保险费应计入固定资产成本。
三、开发阶段的补充医疗保险处理
企业开发阶段发生的补充养老保险费、补充医疗保险费，如果符合资本化条件，应计入无形资产成本。
四、企业与基本医疗保险相关的会计处理
参加基本医疗保险的企业为职工建立补充医疗保险，所需费用在工资总额4%以内的部分，从应付福利费中列支。超过部分应按照政策规定进行处理。
五、缴纳补充医疗保险费
向有关部门缴纳补充医疗保险费时，会计分录为：借应付职工薪酬——补充医疗保险，贷银行存款。
需要注意的是，根据财税[2009]27号文件规定，企业为员工支付的补充养老保险费、补充医疗保险费，在不超过职工工资总额5%标准内的部分，在计算应纳税所得额时准予扣除。超过的部分，不予扣除。因此在期末计算应交所得税时，超过5%的部分应作为应纳税所得额的调减项目。
以上是关于补充医疗保险会计处理的详细步骤。企业在处理过程中应遵循相关会计准则和政策规定，确保会计处理的准确性和合规性。
