稽查查补的税款做账方式如下：根据《国家税务总局关于印发〈增值税日常稽查办法〉的通知》规定，应设置“应交税金--增值税检查调整”专门账户，进行账务调整。查补的增值税应根据不同情况分别处理：若余额在借方，视为留抵进项税额；若余额在贷方，需根据“应交税金--应交增值税”账户的余额情况，进行相应处理。同时，对于少计收入、未计提销项税以及非业务用车修理未记销售收入等问题，需进行特定的账务处理。在补缴增值税的同时，还需补缴城建税、教育费附加。
在税务稽查过程中，对于查补的税款，企业需要按照相关规定进行账务处理。《国家税务总局关于印发〈增值税日常稽查办法〉的通知》中详细说明了查补增值税账务的调整方法。
一、增值税检查调整专门账户的设置
企业在进行账务调整时，应设置“应交税金--增值税检查调整”专门账户。所有与查补税款相关的调整事项都应当在此账户进行记录。
二、账务调整的具体操作
1.检查后应调减账面进项税额或调增销项税额和进项税额转出的，借记“应交税金--增值税检查调整”科目，贷记有关科目。
2.全部调整事项入账后，应根据账户的余额进行转出：
若余额在借方，视为留抵进项税额，转入“应交税金--应交增值税（进项税额）”科目。
若余额在贷方，根据不同情况转入“应交税金--未交增值税”科目或“应交税金--应交增值税”科目。
三、关于特定情况的账务处理
对于少计收入、未开发票少计收入、少计销项税等行为，在补缴增值税的同时需要补缴城建税、教育费附加。具体的账务处理包括：
1.对于前一部分少计收入，需要借：以前年度损益调整，贷：应交税金--增值税检查调整、应交税金--应交城建税、教育费附加、应交企业所得税。
2.对于后一部分非业务用车修理时未记销售收入的情况，需要借：以前年度损益调整（生产成本），贷：应交税金--增值税检查调整，同时缴纳相应的城建税和教育费附加。
四、注意事项
企业在进行账务调整时，应逐期进行，确保税务处理的准确性和合规性。对于不同的税务问题，其账务处理方法也有所不同，企业需要具体问题具体分析，确保税务工作的顺利进行。
以上内容针对“稽查查补的税款是怎么做账？”这一问题进行了详细解答。希望对企业正确处理和记录查补税款有所帮助。
