土增税预征和清算计算方法不相同。预征是根据预售收入乘以预征率计算，而清算则涉及清算时间的确定、收入的确认、扣除额的确定等多方面。预征率由各省、自治区、直辖市地方税务局根据当地情况核定。清算时间根据具体情况确定，包括项目全部竣工、整体转让未竣工决算等情况。
一、预征的方法
预征是按照预售收入乘以预征率来计算，预征率是由各省、自治区、直辖市地方税务局根据当地情况核定的。例如，某房产开发企业预计收入总额50000万元，在2014年一季度取得预售收入10000万元，如果当地核定的土地增值税预征率为2%，那么该企业应预缴的土地增值税为200万元。
二、清算的方法
土地增值税的清算涉及多个方面，主要包括清算时间的确定、收入的确认、扣除额的确定、未出售产品相关事项的确定以及应纳税额的计算等。
1.清算时间的确定：
房地产开发项目全部竣工、完成销售时；
整体转让未竣工决算房地产开发项目时；
直接转让土地使用权时。
主管税务机关在特定情况下也会要求纳税人进行土地增值税清算。
2.收入的确认和扣除项目金额的确定：在清算过程中，需要确认项目的总收入，同时确定可以扣除的项目金额，包括土地出让金、开发成本等。
土增税的预征和清算在计算方法、涉及的内容等方面存在明显的差异。预征主要是基于预售收入进行预缴，而清算则是基于项目的实际收入和支出情况进行最终的土地增值税计算。
