纳税人在申报表中填写减免税款时，需根据所适用的税种和身份进行填写。增值税一般纳税人将抵减金额填入《增值税纳税申报表》第23栏“应纳税额减征额”，根据减征额与应纳税额的关系进行填写，若减征额不足抵减，可结转下期继续抵减。小规模纳税人将抵减金额填入第11栏“本期应纳税额减征额”，填写方式类似。在申报时，需遵循相关通知和政策要求。以上即为针对该问题的解答。
根据《关于增值税税控系统专用设备和技术维护费用抵减增值税税额有关政策的通知》，针对纳税人减免税款在申报表中的填写方式，具体如下：
一、增值税一般纳税人填写方式
1.增值税一般纳税人在填写纳税申报表时，应将可在增值税应纳税额中全额抵减的增值税税控系统专用设备费用及技术维护费，填入《增值税纳税申报表(适用于增值税一般纳税人)》的第23栏，即“应纳税额减征额”。
2.当本期减征额小于或等于第19栏“应纳税额”与第21栏“简易征收办法计算的应纳税额”之和时，按本期减征额实际填写。
3.若本期减征额大于第19栏与第21栏之和，则按这两栏之和填写，本期减征额不足抵减的部分可结转下期继续抵减。
二、小规模纳税人填写方式
1.小规模纳税人应将抵减金额填入《增值税纳税申报表(适用于小规模纳税人)》的第11栏，即“本期应纳税额减征额”。
2.当本期减征额小于或等于第10栏“本期应纳税额”时，按本期减征额实际填写。
3.若本期减征额大于第10栏，则按第10栏填写，减征额不足抵减的部分同样结转下期继续抵减。
以上详细解答了纳税人减免税款在申报表中的填写方法，确保纳税人能正确申报减免税款，避免税务问题。对于会计实操和税收实务的更多了解，可通过相关学习途径继续深化学习。
