付款人与开票时的购货金额不一样是可以的。实际操作中，如果货柜价格以8600元实际支付，剩余400元不再支付，则按实际支付金额8600元进行入账。若按发票金额9000元支付，其中8600元为实际支付金额，剩余400元未来再支付，则按9000元入账，并设立应付账款。支付剩余款项时，再进行相应账务处理。总之，应依据实际情况进行会计处理。
在购销交易中，付款人与开票时的购货金额不一致的情况时有发生。对于这种情况，会计处理方式需要根据具体情况进行调整。以下就您所提到的情况进行详细解答。
一、实际支付金额与发票金额不一致的情况
1.货柜价格与实际支付相符：
如果货柜的价格为8600元，且您公司实际也支付了8600元，同时对方开具的发票金额为9000元，那么您可以按照实际支付金额8600元进行入账。具体的会计分录为：
借：固定资产8600元
贷：现金（或银行存款）8600元
2.剩余金额的处理：
若剩余的400元以后不再需要付给对方，那么这400元的差异可以作为账务调整或费用处理。
二、发票金额与实际支付金额及货柜价格均不一致的情况
如果货柜的价格为9000元，您的公司实际支付8600元，但对方开具的发票金额仍为9000元，那么您应该按照发票金额9000元进行入账。此时的会计分录为：
借：固定资产9000元
贷：现金（或银行存款）8600元
应付账款-XX400元
三、后续支付余额的处理：
若剩余的400元以后需要支付给对方，则当支付此笔款项时，会计分录为：
借：应付账款-XX400元
贷：现金400元。
付款人与开票时的购货金额不一样时，会计处理方式需根据实际情况灵活调整。确保账务处理的准确性，并符合相关会计准则的要求。希望以上解答能够帮助您解决遇到的问题。
