节能控制系统开发的补助款是否缴所得税，需视具体情况而定。根据财税[2008]151号规定，企业取得的国家财政性补贴和其他补贴收入，除特定情况外，应并入实际收到补贴收入年度的应纳税所得额。若政府补贴同时符合资金拨付文件规定的专项用途、有专门的资金管理办法或要求，且企业对该资金及其支出单独核算，可作为不征税收入。不符合这些条件的政府补贴需计入营业外收入，征收企业所得税。
对于节能控制系统开发的补助款是否需要缴纳所得税，可以根据《财政部国家税务总局关于财政性资金、行政事业性收费、政府性基金有关企业所得税政策问题的通知》（财税[2008]151号）的规定进行解答。
一、补助款的基本纳税原则
根据该通知，企业取得的国家财政性补贴和其他补贴收入，除国务院、财政部和国家税务总局规定不计入损益的情况外，应并入实际收到该补贴收入年度的应纳税所得额。这意味着，如果节能控制系统的开发补助款属于财政性补贴，通常情况下需要缴纳企业所得税。
二、不征税收入的特定条件
不过，也存在例外情况。如果企业提供的政府补贴同时符合以下条件，可以作为不征税收入，在计算应纳税所得额时从收入总额中减除：
1.企业能够提供资金拨付文件，且文件中规定该资金的专项用途。
2.财政部门或其他拨付资金的政府部门对该资金有专门的资金管理办法或具体管理要求。
3.企业对该资金以及以该资金发生的支出单独进行核算。
三、实际操作中的要求
对于不具备同时符合以上三个条件的政府补贴，则需要计入营业外收入，征收企业所得税。企业在处理这类补贴时，需要对其有清晰的账目记录和管理，确保符合税务部门的要求。
节能控制系统开发的补助款是否需要缴纳所得税，要根据具体的补贴性质和条件来判断。企业应当仔细研究相关税收政策，确保合规操作，避免不必要的税务风险。
