两个独立核算单位合并到一个单位的核算方式包括凭证合并和新建帐套两种。凭证合并是直接出凭证将一个单位的余额表合并到另一个单位，会导致本月目标单位很多项目发生额增大，未分配利润等科目直接进入发生额。新建帐套则是将原来两个单位的账务处理完后合并余额表，不同科目分别独立建立会计科目，并录入期初余额及合并前的发生额。合并过程需注意分公司与母公司之间的账务结转。
当两个独立核算的单位合并为一个单位时，核算工作显得尤为重要。为确保合并后的账务清晰、准确，通常有两种主要的核算方式。
一、凭证合并方式
凭证合并是一种直接的方式，通过出凭证将两个单位的余额表进行合并。这种方式下，本月目标单位的很多项目发生额会显得很大，因为包含了两个独立单位的业务。同时，未分配利润等科目会直接体现在发生额中。这种方法的操作相对简单，但需要注意合并过程中的数据准确性，避免出现误差。
二、新建帐套方式
新建帐套方式则是先将原来两个单位的账务分别处理完毕，然后将余额表合并。在此基础上，不同科目分别独立建立会计科目。接着，录入期初余额及合并前的发生额。这种方式下，合并后的账务更加清晰，每个科目的来源都有明确的记录。为了查询合并前的账目，需要登录原来的帐套进行查询。
在具体操作中，涉及到分公司和母公司的账务结转。例如，分公司借记“其他应付款”和“未分配利润”（如果是累计亏损则为贷方），贷记“应收账款”。分公司结转后，账面应全部结清。母公司则根据具体情况借记“应收账款”，贷记“其他应付款”和“未分配利润”（如果是亏损则为借方）。
两种核算方式都有各自的特点和适用场景。企业在选择时，应根据自身的实际情况和需要进行选择，确保合并过程中的账务清晰、准确。同时，在合并过程中，还需要注意与相关部门和人员的沟通协作，确保数据的准确性和完整性。
